当前位置:

PROTAC药物

PROTAC的优势:



体外试验:

蛋白质印迹

PROTACs下调靶标蛋白质的水平


ELISA


ELISA测定ARV-771处理16 h对细胞c-MYC的抑制水平。


IHC

Panc-1细胞中PRTC通透性的鉴定

PRTC诱导内源性CREPT蛋白的泛素化和蛋白酶体依赖性降解


流式细胞术

采用碘化丙啶(PI)/Annexin-V染色结合流式细胞术检测细胞凋亡



细胞毒性

PROTAC对细胞毒性的影响


体内分析







示例


DCAF15 E3连接酶衍生的PROTAC的在体外和体内降解BRD4的设计和表征。


(A) PROTACs设计方案。(B)用所示浓度的DP1处理SU-DHL-4细胞16 h后,BET蛋白和ACTIN的免疫印迹实验结果。在每个通道计算蛋白质降解活性水平相对于DMSO对照的百分比。(C)用20 μM DP1处理SU-DHL-4细胞,按设定的时间孵育后,BRD4和ACTIN的免疫印迹实验结果。(D)左图:在SU-DHL-4细胞中,用20 μM的配体JQ1和E7820预处理4小时后,再用20 μM的DP1处理14小时后,BRD4和ACTIN的免疫印迹实验结果。右图:在SU-DHL-4细胞中,Carfilzomib (0.2 μM)或MLN4924 (1 μM)预处理4 h后,再经20 μM DP1处理14 h后,BRD4和ACTIN的免疫印迹实验结果。(E)克隆12和亲代细胞用所示浓度的DP1处理24小时后,BRD4和ACTIN的免疫印迹实验结果。(F)用DP1处理48 h的SU-DHL-4细胞的细胞活力分析,比较其组分配体JQ1、E7820和DP1(R) (n = 3)。(G)用JQ1、E7820、DP1(R)和DP1处理SU-DHL-4细胞24小时,免疫印迹实验分析BRD4、c-MYC、裂解PARP、Caspase 3和ACTIN。(H)溶媒对照和DP1 (100 mg/kg)处理小鼠12天的肿瘤体积,n = 8。(I)溶媒对照和DP1治疗小鼠的肿瘤重量。(J)溶媒对照和DP1处理小鼠的肿瘤裂解物中的 BRD4, c-MYC,和ACTIN的免疫印迹结果。



参考文献

  1. Li, L., Mi, D., Pei, H. et al. In vivo target protein degradation induced by PROTACs based on E3 ligase DCAF15. Sig Transduct Target Ther 5, 129 (2020). https://doi.org/10.1038/s41392-020-00245-0

  2. Bondeson, D., Mares, A., Smith, I. et al. Catalytic in vivo protein knockdown by small-molecule PROTACs. Nat Chem Biol 11, 611–617 (2015). https://doi.org/10.1038/nchembio.1858

  3. Raina, Kanak; Lu, Jing; Qian, Yimin; Altieri, Martha; Gordon, Deborah; Rossi, Ann Marie K.; Wang, Jing; Chen, Xin; Dong, Hanqing; Siu, Kam; Winkler, James D.; Crew, Andrew P.; Crews, Craig M.; Coleman, Kevin G. (2016). PROTAC-induced BET protein degradation as a therapy for castration-resistant prostate cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences, (), 201521738–. doi:10.1073/pnas.1521738113 

  4. Ma, D., Zou, Y., Chu, Y., Liu, Z., Liu, G., Chu, J., … Chang, Z. (2020). A cell-permeable peptide-based PROTAC against the oncoprotein CREPT proficiently inhibits pancreatic cancer. Theranostics, 10(8), 3708–3721. doi:10.7150/thno.41677 

  5. Ma, D., Zou, Y., Chu, Y., Liu, Z., Liu, G., Chu, J., … Chang, Z. (2020). A cell-permeable peptide-based PROTAC against the oncoprotein CREPT proficiently inhibits pancreatic cancer. Theranostics, 10(8), 3708–3721. doi:10.7150/thno.41677 

  6. Zhao, Qiuye; Lan, Tianlong; Su, Shang; Rao, Yu (2019). Induction of apoptosis in MDA-MB-231 breast cancer cells by a PARP1-targeting PROTAC small molecule. Chemical Communications, (), 10.1039.C8CC07813K–. doi:10.1039/C8CC07813K 

  7. https://www.arvinas.com/pipeline-programs/androgen-receptor