单细胞转录组测序，以单个细胞为特定研究对象进行转录组测序，并对获得的数据进行生物信息学统计分析的新技术。基于微流控和 barcode 标记等技术可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况，并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析，绘制大规模单细胞表达图谱。单细胞测序技术被Nature Methods（2013）评为年度技术，Science（2013）评为年度六大生物类科研热点的首位。单细胞测序技术又在2015年度登上Science转化医学封面。 Nature Methods 将2019年年度技术又给了单细胞多组学。2013年以来基于单细胞测序技术获得了多方面的研究进展，文献发表也呈现迅猛增长趋势。即使来源相同的单个细胞，由于随机生物过程和环境扰动的原因，彼此在许多方面也存在差异，即异质性。尤其是肿瘤细胞、免疫细胞、胚胎发育期细胞、干细胞等最为突出。常规的组学技术避免不了这一现象带来的影响，由此研究人员开启了单细胞测序技术的探索之路。
在生物学和医学领域将基因和表型对应起来是一个长期的挑战，转录组分析是一种有效的解决方法。尽管我们体内每个细胞都拥有几乎相同的基因型，但是标准的高通量测序只能提供细胞合集的基因表达的平均信号，我们身体中许多不同类型的细胞都有不同的转录组，每个细胞的转录组信息只反映一小部分基因的活性。
实验流程
应用
识别免疫细胞和组织的复杂性，以确定新的治疗靶点
识别新的免疫细胞群及其关系
识别新的免疫细胞群及其关系
癌症干细胞的鉴定为复杂的肿瘤内部异质性提供新的见解
对不同类型干细胞进行测序在干细胞领域新发现的应用
技术特点
真正意义上的单细胞检测（每一个细胞形成单独的GEMs，分别进行细胞标记）
超低的单个细胞价格
多细胞捕获率低（小于万分之八）
超高的捕获效率（单个细胞捕获效率65%）
全自动真正单细胞分离、实验周期短
超高的细胞通量（每个样本最多可测10000个细胞）
细胞类型多样化（适宜40微米直径以内，无下限）
通量高（可同时检测8个样本）
友情链接： 上海芯超生物http://www.superchip.com.cn/biology/jiyincexu.html
